Przez cztery lata produkcji serial „Prison Break” miał szansę na zdobycie kilkunastu wręcz różnych nagród w kilku kategoriach. Najlepiej odebrano pierwszy sezon, a jedyną nagrodę z wielu nominacji zdobył właśnie za tę serię. Jakie elementy „Prison Break” zostały docenione?
W 2006 roku serial „Prison Break”, świeżo po pierwszym sezonie, był u szczytu popularności. Otrzymał nagrodę ALMA w kategorii najlepsza reżyseria w produkcji telewizyjnej, którą odebrał Jesus Salvador Trevino. W tym samym roku do nagrody ALMA nominowano także Amaury’go Nolasco za najlepszą drugoplanową rolę w serialu telewizyjnym. Ogromnym wyróżnieniem byłydwie nominacje do Złotych Globów, które „Prison Break” otrzymał po pierwszym sezonie. Nominowano zarówno samą produkcję w kategorii najlepszy serial dramatyczny, jak i odtwórcę głównej roli Wentwortha Millera. W tym samym roku Miller był też nominowany do nagrody Saturn. W 2006 roku doceniono Roberta Kneppera, który za rolę T-Baga dostał nominację do nagrody Satellite. Również temat muzyczny z „Prison Break” wyróżniono nominacją do nagrody Emmy.